寻源宝典降落PCR如何调整退火温度
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上海抚生实业有限公司
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介绍:
降落PCR(Touchdown PCR)通过逐步降低退火温度来提高扩增的特异性。具体调整方法如下:
- 初始设定:
- 温度梯度下降:
- 维持低退火温度:
- 最终循环: 通过这种策略,降落PCR能够在早期循环中减少非特异性扩增,
降落PCR(Touchdown PCR)通过逐步降低退火温度来提高扩增的特异性。具体调整方法如下:
1. 初始设定:开始时选择的退火温度应高于引物的Tm值,通常比Tm值高15度左右。这样可以确保在初始循环中,只有高度特异性的结合发生,避免非特异性扩增。
2. 温度梯度下降:在每个循环或每几个循环后,退火温度以1或n的增量逐步降低,直到接近或低于引物的Tm值。这种温度的逐步下降帮助在早期循环中积累特异性的扩增子。
3. 维持低退火温度:当退火温度降至非特异扩增开始的水平时,特异产物已经积累到足以压制非特异性扩增。此时,退火温度保持在较低水平,以便高效扩增目标序列。
4. 最终循环:在退火温度降至目标水平后,进行10个左右的循环,以维持该温度,确保特异性扩增。
通过这种策略,降落PCR能够在早期循环中减少非特异性扩增,同时在后期循环中提高扩增效率。

