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ksm29rd4

更新时间:2026-08-02

概述

ksm29rd4/64mer是一种长度为64个碱基的寡核苷酸序列,在分子生物学研究中具有重要应用。这类定制合成的寡核苷酸通常用于精确的基因操作实验,其序列设计往往针对特定研究需求。 在实际应用中,研究人员会发现64mer长度的寡核苷酸既能提供足够的特异性,又不会因过长而增加合成难度和成本。这种长度的序列特别适合作为基因编辑工具(如CRISPR)的引导RNA模板,或在基因合成中作为重叠延伸片段。

物理化学性质

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ksm29rd4/64mer在室温下通常以冻干粉形式存在,溶解后形成无色透明溶液。其紫外吸收特征与标准DNA相同,A260/A280比值约1.8-2.0,纯度通常≥95%。 这种寡核苷酸的Tm值(熔解温度)取决于其具体序列组成,一般在70-90°C范围。64mer长度足以形成稳定的二级结构,这在某些应用如适体筛选或核酶设计中尤为重要。HPLC分析显示主峰占比高,表明合成质量良好。

主要用途

在CRISPR基因编辑系统中,ksm29rd4/64mer常作为模板合成sgRNA,其长度足以包含必要的支架序列和靶向序列。研究显示,64mer长度的引导RNA模板在转染效率和编辑特异性间达到较好平衡。 另一重要应用是基因合成中的片段组装。作为重叠延伸PCR的组成部分,64mer片段既能保证足够重叠区域(通常20-30bp),又能有效减少所需片段数量。此外,它还用于荧光原位杂交(FISH)探针、甲基化研究引物等高特异性应用场景。

安全与储存

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虽然ksm29rd4/64mer本身生物风险较低,但涉及基因操作的实验需遵守实验室生物安全规范。建议在BSL-2环境下操作,特别是当序列来源于或靶向病原体基因时。 储存方面,冻干粉在-20°C下可稳定保存2年以上,溶解后宜分装保存于-80°C,避免反复冻融。溶液形式在4°C可保存1个月,但长期储存可能导致水解降解。使用前应通过电泳或紫外分光验证完整性。

B2B采购指南

采购此类定制寡核苷酸时,首要关注点是合成纯度和序列准确性。要求供应商提供质谱(MALDI-TOF)和毛细管电泳(CE)分析报告,确保序列正确且全长产物占比≥90%。 价格通常按碱基数量计算,64mer的合成成本约在200-500元/条,大批量订购可获折扣。交货周期一般为3-7个工作日,加急服务需额外费用。建议选择提供免费重合成保障的供应商,以应对可能的合成错误。

常见问题

如何验证收到的寡核苷酸质量?

可通过紫外分光光度计测A260/A280比值(应1.8-2.0),PAGE或CE电泳检查主带比例,质谱确认分子量。有条件还可做Sanger测序验证序列。

溶解后出现浑浊怎么办?

可能是盐析出或污染,建议离心后取上清。若无效,可尝试加热至65°C助溶或加入少量DMSO。严重浑浊应联系供应商更换。

64mer和更短 oligo 如何选择?

需平衡特异性和成本。20-30mer适合常规PCR,40-60mer用于qPCR探针,60-80mer适合基因编辑和合成。64mer在多数应用中性价比最佳。

如何延长储存寿命?

冻干粉分装后-20°C保存,溶解后分装-80°C储存。避免反复冻融,可加入稳定剂如EDTA或甘油。使用时置于冰上,用后立即放回冷冻。

合成失败常见原因有哪些?

高GC含量(>70%)或连续重复序列可能导致合成困难,可要求供应商采用特殊合成程序。极端AT含量也可能影响产率,需提前沟通优化方案。

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